RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 OSTM1Q86WC4 334 aa19.03■□□□□ 0.64
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SH3BP1-202ENST00000417536 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC4Q9HBW1 653 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRAC1Q9NRG0 131 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
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SH3BP1-202ENST00000417536 SOCS4Q8WXH5 440 aa19.02■□□□□ 0.64
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SH3BP1-202ENST00000417536 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
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SH3BP1-202ENST00000417536 MMEL1Q495T6 779 aa19.02■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa19.01■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM114B3SHH9 223 aa19■□□□□ 0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 SHROOM3Q8TF72 1996 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 HAS3O00219 553 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 NFKB1P19838 968 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3R1P27986 724 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 BNIPLQ7Z465 357 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 GCNAQ96QF7 691 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
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