RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 PCDH8O95206 1070 aa8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 GIMD1P0DJR0 217 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 RAD23BP54727 409 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 PPP3CAQ08209 521 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 SPIDRQ14159 915 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 ARID5BQ14865 1188 aa8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 RNF34Q969K3 372 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 USP29Q9HBJ7 922 aa8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 DMAC2Q9NW81 257 aa8.3□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 A6NNZ2 444 aa8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 IKBKBO14920 756 aa8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 EFSO43281 561 aa8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 IGLV3-27P01718 113 aa8.29□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 LTFP02788 710 aa8.29□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 TTC39CQ8N584 583 aa8.29□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.29□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.29□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.29□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 C10orf142B7Z368 130 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 F5H5T6 163 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 M0QYV0 167 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 AQP9O43315 295 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 SETSIPP0DME0 302 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 JUNDP17535 347 aa8.28□□□□□ -1.08
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PCNX1-215ENST00000557428 ZNF284Q2VY69 593 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.28□□□□□ -1.08
PCNX1-215ENST00000557428 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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