RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DNPEPQ9ULA0 475 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MFSD11O43934 449 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ICMTO60725 284 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ASLP04424 464 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TYRP14679 529 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CCNCP24863 283 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RBL1P28749 1068 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MMP13P45452 471 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CUL1Q13616 776 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ADGRE1Q14246 886 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MPP7Q5T2T1 576 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF783Q6ZMS7 281 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MFSD6LQ8IWD5 586 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PRELID2Q8N945 189 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 OR7D4Q8NG98 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SUSD6Q92537 303 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IGSF8Q969P0 613 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SNF8Q96H20 258 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ASB16Q96NS5 453 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 AGAP3Q96P47 875 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC3Q9BY71 257 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 POMKQ9H5K3 350 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC19Q9H756 370 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DRGXA6NNA5 263 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FAM72CH0Y354 149 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 KCNK1O00180 336 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RNF103O00237 685 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TTI1O43156 1089 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CNTN5O94779 1100 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PRAMEF12O95522 483 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IGSF6O95976 241 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PLTPP55058 493 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC7A5Q01650 507 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 KDSRQ06136 332 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IL10RBQ08334 325 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 RUNX3Q13761 415 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 STARD3Q14849 445 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 FAM72BQ86X60 149 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PDIK1LQ8N165 341 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 OTUD6BQ8N6M0 293 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MYADMQ96S97 322 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ECI2O75521 394 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GLP2RO95838 553 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 OLFM2O95897 454 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IGLV3-27P01718 113 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ITGAVP06756 1048 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CCNB1P14635 433 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ITIH2P19823 946 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CES1P23141 567 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CSKP41240 450 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 MAPK8P45983 427 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ARL4CP56559 192 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ALFQ53S48 1182 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ACDQ96AP0 544 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 HMCESQ96FZ2 354 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 PNKPQ96T60 521 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LGMNQ99538 433 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 BFARQ9NZS9 450 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 THEGQ9P2T0 379 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 A0A0A0MRY4 1105 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.78□□□□□ -1.48
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