RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PRR23AA6NEV1 266 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 F8W810 466 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KATNA1O75449 491 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KLF10Q13118 480 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ARCQ7LC44 396 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RMND5AQ9H871 391 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ING3Q9NXR8 418 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 WWOXQ9NZC7 414 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ING4Q9UNL4 249 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TISP43B9A030 160 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC7A2P52569 658 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 AMHR2Q16671 573 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HGSNATQ68CP4 663 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PEAK1Q9H792 1746 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KLHL1Q9NR64 748 aa14.89□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF197O14709 1029 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MAGEB3O15480 346 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CCNB1P14635 433 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SPATA20Q8TB22 786 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 C10orf82Q8WW14 230 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 OMDQ99983 421 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CSADQ9Y600 493 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MT-ND1P03886 318 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FAM131BQ86XD5 332 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FANCGO15287 622 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CYP7B1O75881 506 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ITGB3P05106 788 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FICDQ9BVA6 458 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 M0QYT0 321 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 DCAF15Q66K64 600 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 VSTM1Q6UX27 236 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 VPS45Q9NRW7 570 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CYB561D2O14569 222 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SSNA1O43805 119 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 NDUFB10O96000 172 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 GSTM1P09488 218 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SMYD1Q8NB12 490 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FAM167AQ96KS9 214 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 OLFM1Q99784 485 aa14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ATP6AP2O75787 350 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RBP5P82980 135 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 ACOX2Q99424 681 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MYL4P12829 197 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CYP24A1Q07973 514 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CBR4Q8N4T8 237 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 SPASTQ9UBP0 616 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 GUCA1CO95843 209 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 EFNA5P52803 228 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 PRKCEQ02156 737 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 KRT33BQ14525 404 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PCNX1-202ENST00000439984 TEKT5Q96M29 485 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms