RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580948.1

LINC00511-211, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 3

Gene LINC00511, Length 475 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-211ENST00000580948 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SLC18A3Q16572 532 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ANO7Q6IWH7 933 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 C11orf74Q86VG3 221 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 CNGA4Q8IV77 575 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 APCDD1Q8J025 514 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 FNIP1Q8TF40 1166 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 UCMAQ8WVF2 138 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ALG14Q96F25 216 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MYO19Q96H55 970 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 THAP2Q9H0W7 228 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 TMEM245Q9H330 911 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SLC32A1Q9H598 525 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MPP6Q9NZW5 540 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SCINQ9Y6U3 715 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 EML5Q05BV3 1969 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 LNP1A1A4G5 178 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SRGAP2O75044 1071 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 GABRG2P18507 467 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 BCKDHBP21953 392 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PSMA2P25787 234 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PLK1P53350 603 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SEMA3BQ13214 749 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SLC12A1Q13621 1099 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 LRRC31Q6UY01 552 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 FRMD1Q8N878 549 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 HMGB4Q8WW32 186 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PEBP4Q96S96 227 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 FZD10Q9ULW2 581 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 RAD54BQ9Y620 910 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 TAF4O00268 1085 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 LRCH4O75427 683 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ALDH1A2O94788 518 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 LRIG2O94898 1065 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ASLP04424 464 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 C7P10643 843 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 HLA-EP13747 358 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NDUFV2P19404 249 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 FECHP22830 423 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MIPP30301 263 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NUMBP49757 651 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 OXCT1P55809 520 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ECT2LQ008S8 904 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 E2F5Q15329 346 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SDE2Q6IQ49 451 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NLRP14Q86W24 1093 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF366Q8N895 744 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 DEFB124Q8NES8 71 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 RLN3Q8WXF3 142 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 PSMB7Q99436 277 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 NUP85Q9BW27 656 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00511-211ENST00000580948 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms