RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281455.6

ACSL1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase long chain family member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSL1, Length 3,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1-201ENST00000281455 NAGLUP54802 743 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 MARK4Q96L34 752 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 DONSONQ9NYP3 566 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 CLUHO75153 1309 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 NDUFS3O75489 264 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 IFNEQ86WN2 208 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 SERPINB11Q96P15 392 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 FAM50BQ9Y247 325 aa14.84□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 A8MUI8 341 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 CYP2C18P33260 490 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 CRYMQ14894 314 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 MTFR1Q15390 333 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 FITM2Q8N6M3 262 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 GCNAQ96QF7 691 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 EGFL8Q99944 293 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 HCSTQ9UBK5 93 aa14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
ACSL1-201ENST00000281455 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 PIRO00625 290 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 FCHO1O14526 889 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 PTPN9P43378 593 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ZNF460Q14592 562 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 FAM189A1O60320 539 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 MYL4P12829 197 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 RAG1P15918 1043 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 PGAM1P18669 254 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 SLC11A2P49281 568 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 CACNA2D1P54289 1103 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 STX1BP61266 288 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 USP4Q13107 963 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 MFSD5Q6N075 450 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 NUP93Q8N1F7 819 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 GPAMQ9HCL2 828 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.83□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 GLRA3O75311 464 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 STMN1P16949 149 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 GEMP55040 296 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 GALNT3Q14435 633 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 HIC1Q14526 733 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ITIH4Q14624 930 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ACAD11Q709F0 780 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 SEMA3CQ99985 751 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 PIDD1Q9HB75 910 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ITGA2BP08514 1039 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 MOGSQ13724 837 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 TEKT4Q8WW24 435 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 MOCOSQ96EN8 888 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ACOT9Q9Y305 439 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 RHOCP08134 193 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 PDK4Q16654 411 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 SGO1Q5FBB7 561 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 LINGO4Q6UY18 593 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 CASP10Q92851 521 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 APOL5Q9BWW9 433 aa14.82□□□□□ -0.04
ACSL1-201ENST00000281455 NUF2Q9BZD4 464 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms