RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362		H3BN98	237 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	IL6	P05231	212 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PCSK1	P29120	753 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CRADD	P78560	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	IER5	Q5VY09	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TEKT5	Q96M29	485 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MECR	Q9BV79	373 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	AGPS	O00116	658 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CD4	P01730	458 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MPO	P05164	745 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EPHA3	P29320	983 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ADSS	P30520	456 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	COX10	Q12887	443 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NFIX	Q14938	502 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TAB1	Q15750	504 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	METTL6	Q8TCB7	284 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RCN3	Q96D15	328 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	VCL	P18206	1134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	S100A1	P23297	94 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GPC1	P35052	558 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	IL12A	P29459	219 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NPY2R	P49146	381 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SOX10	P56693	466 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	C19orf60	Q96EN9	201 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	OLFM1	Q99784	485 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MGRN1	O60291	552 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SEMA3D	O95025	777 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PCNA	P12004	261 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	AMPD1	P23109	780 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MIP	P30301	263 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RFX3	P48380	749 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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