RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 TBL1XO60907 577 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 PTGIRP43119 386 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 SGSHP51688 502 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 GALNT2Q10471 571 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ALLCQ8N6M5 410 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 NETO2Q8NC67 525 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RIN3Q8TB24 985 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 DDI1Q8WTU0 396 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 NDFIP2Q9NV92 336 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 OBP2AQ9NY56 170 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 DENND4AQ7Z401 1863 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 C5orf42Q9H799 3197 aa24.5■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 GFRA2O00451 464 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 DLL1O00548 723 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 VIPR2P41587 438 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 SLC7A5Q01650 507 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 E2F7Q96AV8 911 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RAB17Q9H0T7 212 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 POMKQ9H5K3 350 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RAMP2O60895 175 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 AP1B1Q10567 949 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 AFMIDQ63HM1 303 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC89Q8N998 374 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 HLA-CQ95604 372 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 MYADMQ96S97 322 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TERF1P54274 439 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 PARP15Q460N3 678 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 MPP7Q5T2T1 576 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TP53INP2Q8IXH6 220 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 HDAC11Q96DB2 347 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ASB2Q96Q27 587 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 LGMNQ99538 433 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 NCOR1O75376 2440 aa24.48■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 H0Y626 953 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 KCNN4O15554 427 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 IFNB1P01574 187 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RBL1P28749 1068 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 CARNMT1Q8N4J0 409 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RASA4BC9J798 803 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 H3BQ06 376 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RASA4O43374 803 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 KRT14P02533 472 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 UQCRHP07919 91 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RHOCP08134 193 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ACTN2P35609 894 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 IFNAR2P48551 515 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 PTK6Q13882 451 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ELF2Q15723 593 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 BHMTQ93088 406 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 ERP44Q9BS26 406 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 MAGEH1Q9H213 219 aa24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
MEIS3-204ENST00000558555 MTSS1O43312 755 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms