RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPP10Q8N608 796 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX27Q96L92 541 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR81Q562E7 1941 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 STMND1H3BQB6 276 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 J3KTA2 159 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASAP2O43150 1006 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ13O60928 360 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGSF3O75054 1194 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT36O76013 467 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGB8P26012 769 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 STAT1P42224 750 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGBP1P78318 339 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEMA5AQ13591 1074 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRM3Q14832 879 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT71Q3SY84 523 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERAP2Q6P179 960 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PALB2Q86YC2 1186 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHKBQ93100 1093 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 FIZ1Q96SL8 496 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL21RQ9HBE5 538 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR23AA6NEV1 266 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 POM121BA6NF01 834 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 VSTM5A8MXK1 200 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SP1P08047 785 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA5P08648 1049 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PEPDP12955 493 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF12P17014 697 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGFR2P21802 821 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLRC2P26717 231 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP6Q16828 381 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 NXNQ6DKJ4 435 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 AAGABQ6PD74 315 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MDGA2Q7Z553 956 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLBQ86Z14 1044 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPRY4Q9C004 299 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2W5A6NFC9 320 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KPNA5O15131 536 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDST3O95803 873 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINB2P05120 415 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 F7P08709 466 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 EGR1P18146 543 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIK3CBP42338 1070 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUDT6P53370 316 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAS2R50P59544 299 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNF4GQ14541 408 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM1BQ8NB78 822 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 DONSONQ9NYP3 566 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01553A4QN01 128 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERINC4A6NH21 518 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ18B7U540 433 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0QYT0 321 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKX2-8O15522 239 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 GABRB3P28472 473 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 AVPR1AP37288 418 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMTP48728 403 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP10-12P60413 245 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBA1BP68363 451 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms