RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RHOCP08134 193 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CD48P09326 243 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TNNT1P13805 278 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ERCC2P18074 760 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 AMPD1P23109 780 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 GJC1P36383 396 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ETFBP38117 255 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CLCN5P51795 746 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 NDST2P52849 883 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RWDD2BP57060 319 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 COPS2P61201 443 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 GNA12Q03113 381 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 SULT2A1Q06520 285 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MESP2Q0VG99 397 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 LMAN2Q12907 356 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 FZD5Q13467 585 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CCINQ13939 588 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 DPYSL3Q14195 570 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 LRRC32Q14392 662 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TAZQ16635 292 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 GEN1Q17RS7 908 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 AHI1Q8N157 1196 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 LZTR1Q8N653 840 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TERB1Q8NA31 727 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 EXD1Q8NHP7 514 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 KRT35Q92764 455 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CLDN23Q96B33 292 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 FAF2Q96CS3 445 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ALG14Q96F25 216 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 HES6Q96HZ4 224 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RNF157Q96PX1 679 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CALN1Q9BXU9 219 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MAGEH1Q9H213 219 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 DNAI1Q9UI46 699 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.35□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 A0A0D9SEW6 157 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 USP27XA6NNY8 438 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 DCLK1O15075 740 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 NPC1O15118 1278 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RAMP2O60895 175 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 FTCDO95954 541 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 KRT1P04264 644 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CETN2P41208 172 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CSKP41240 450 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 CDKN2BP42772 138 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MARCKSL1P49006 195 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 KDSRQ06136 332 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 SLC20A2Q08357 652 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MMRN1Q13201 1228 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 RPS6KA1Q15418 735 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 PARP15Q460N3 678 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 AFMIDQ63HM1 303 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM215Q68D42 235 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MBLAC2Q68D91 279 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 APCDD1Q8J025 514 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 PQLC3Q8N755 202 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 KDM1BQ8NB78 822 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 FLCNQ8NFG4 579 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 PJA1Q8NG27 643 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.34□□□□□ -1.07
ABCD4-216ENST00000493752 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms