RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 NPWQ8N729 165 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 GGA2Q9UJY4 613 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.871e-16■■■□□ 16.1
ACTB-210ENST00000477812 KAT7O95251 611 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CSKP41240 450 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 GRIA2P42262 883 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PLK1P53350 603 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FUT11Q495W5 492 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SLC35F6Q8N357 371 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SHDQ96IW2 340 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RNF157Q96PX1 679 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ILVBLA1L0T0 632 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PRRT4C9JH25 899 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PYGMP11217 842 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ALADP13716 330 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PTPN7P35236 360 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CCINQ13939 588 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PPP2R5EQ16537 467 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 LRRC19Q9H756 370 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DNAI1Q9UI46 699 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 HCN2Q9UL51 889 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 A0A0D9SEW6 157 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 K7EQS6 105 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FANCGO15287 622 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DAPK3O43293 454 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 EGFP01133 1207 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RHOCP08134 193 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DRD1P21728 446 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 OXCT1P55809 520 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 COPS2P61201 443 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 GNA12Q03113 381 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SLC12A1Q13621 1099 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RPS6KA1Q15418 735 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 APCDD1Q8J025 514 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 AHI1Q8N157 1196 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 WDR24Q96S15 920 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PSMB7Q99436 277 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FOXQ1Q9C009 403 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ANTXRLA6NF34 631 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 RAMP2O60895 175 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 APODP05090 189 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 KRT10P13645 584 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 DNA2P51530 1060 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ADCY2Q08462 1091 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.866e-7■□□□□ 10
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ACTB-210ENST00000477812 DMC1Q14565 340 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 AADACL2Q6P093 401 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 PLD5Q8N7P1 536 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 OR7D4Q8NG98 312 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 EXOC4Q96A65 974 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TTC17Q96AE7 1141 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 MAGEH1Q9H213 219 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 DONSONQ9NYP3 566 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ENC1O14682 589 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 MFSD11O43934 449 aa20.44■□□□□ 0.86
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