RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS6KA3P51812 740 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF131P52739 623 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD18Q0P651 414 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 AP1B1Q10567 949 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 DYRK1AQ13627 763 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM187BQ17R55 369 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 LY6KQ17RY6 165 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GLRX5Q86SX6 157 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 P3H2Q8IVL5 708 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CADM4Q8NFZ8 388 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNJ9Q92806 393 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM162AQ96A26 154 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SPAG5Q96R06 1193 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 STRA6Q9BX79 667 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MSL2Q9HCI7 577 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KLQ9UEF7 1012 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CHD1O14646 1710 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNJ18B7U540 433 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMD9O00233 223 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FMO6PO60774 539 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PAGE4O60829 102 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRM4P08173 479 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR35P0CG20 571 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 AVPR2P30518 371 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CIITAP33076 1130 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MTNR1AP48039 350 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBB3Q13509 450 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SLMAPQ14BN4 828 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR162Q16538 588 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ISM2Q6H9L7 571 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM132EQ6IEE7 984 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CNSTQ6PJW8 725 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SPC24Q8NBT2 197 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GLMPQ8WWB7 406 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FIZ1Q96SL8 496 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD2Q9GZV1 360 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PEMTQ9UBM1 199 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms