RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 TAF10Q12962 218 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00303Q3SY05 128 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 FAM171BQ6P995 826 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SAP25Q8TEE9 199 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 RFFLQ8WZ73 363 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 BIRC7Q96CA5 298 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 P2RY11Q96G91 374 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 HPDLQ96IR7 371 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF560Q96MR9 790 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 KCND1Q9NSA2 647 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 WDR70Q9NW82 654 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 LRRK1Q38SD2 2015 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC18AA5D8T8 446 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 COCHO43405 550 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 LCA5LO95447 670 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 MT-CO3P00414 261 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 TYRP14679 529 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CLCN1P35523 988 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PNPLA4P41247 253 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 KIF11P52732 1056 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PTK2Q05397 1052 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 INCA1Q0VD86 236 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 STARD3Q14849 445 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC18BQ6UXF7 455 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 LIMS2Q7Z4I7 341 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC170Q8IYT3 715 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 LSMEM2Q8N112 164 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC18CQ8NCF0 446 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 MYLPFQ96A32 169 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 DESI2Q9BSY9 194 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 BBS2Q9BXC9 721 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 HAUS4Q9H6D7 363 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CISHQ9NSE2 258 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ATP8B3O60423 1300 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 RP1P56715 2156 aa10.49□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 GABRDO14764 452 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 DFNA5O60443 496 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 GREM1O60565 184 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 NDUFA10O95299 355 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 WNT1P04628 370 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 FAM87AP0C7U9 286 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 IRF1P10914 325 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ACADMP11310 421 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 LMO2P25791 158 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PPP3CCP48454 512 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CACNA2D1P54289 1103 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 C21orf59P57076 290 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ERVPABLB-1P60509 514 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ARID5AQ03989 594 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ILKQ13418 452 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ENPP2Q13822 863 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 IGFBP7Q16270 282 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 TPGS1Q6ZTW0 290 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 FAM26EQ8N5C1 309 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ACRBPQ8NEB7 543 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SLC20A1Q8WUM9 679 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 EXTL1Q92935 676 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PHF12Q96QT6 1004 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 THSD1Q9NS62 852 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-211ENST00000429899 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms