RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DTLQ9NZJ0 730 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 COPG2Q9UBF2 871 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 HESX1Q9UBX0 185 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 RALBP11234 206 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DESP17661 470 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MGAT1P26572 445 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 USP41Q3LFD5 358 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CES3Q6UWW8 571 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC4CQ8WTT0 213 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 COG4Q9H9E3 785 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR10Q9NXD2 777 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 E9PBE3 544 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL41O60662 606 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A27O95847 323 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC5A2P31639 672 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 EMP3P54852 163 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 BORAQ6PGQ7 559 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 EPGNQ6UW88 154 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CYS1Q717R9 158 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ACOT1Q86TX2 421 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TNS4Q8IZW8 715 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DDI1Q8WTU0 396 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CDKL2Q92772 493 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CD1EP15812 388 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DPYSL2Q16555 572 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PAOXQ6QHF9 649 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 COPS5Q92905 334 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC37A2A6NM11 1700 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-10P10266 1014 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TGFB3P10600 412 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TYK2P29597 1187 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF410Q86VK4 478 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 AGR3Q8TD06 166 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BSA7 217 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 AIM2O14862 343 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 IGBP1P78318 339 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CDKL1Q00532 357 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CREB5Q02930 508 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SULT2A1Q06520 285 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD2Q14681 263 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC185Q8N715 623 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINI1Q99574 410 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH19Q9H159 772 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.73■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GOT1P17174 413 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 NR2C2P49116 596 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT2P50583 147 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GALK1P51570 392 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 NR1H2P55055 460 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 INSCQ1MX18 579 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PKDCCQ504Y2 493 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM110Q86TL2 294 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LILRA2Q8N149 483 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A5Q9BY07 1137 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PDGFCQ9NRA1 345 aa18.72■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DPP3Q9NY33 737 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms