RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 AMHP03971 560 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MCF2P10911 925 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MAGEA12P43365 314 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC80Q76M96 950 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CNTD1Q8N815 330 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 DEPTORQ8TB45 409 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 VPS33BQ9H267 617 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM64BA6NI03 449 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 C9IYK1 514 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 G3V2L1 256 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MED7O43513 233 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 PSMD8P48556 350 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 PDK2Q15119 407 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ISL2Q96A47 359 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 H3BMQ9 156 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 HDAC3O15379 428 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 HK2P52789 917 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 RHDQ02161 417 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SEMA5AQ13591 1074 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 PGM5Q15124 567 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 DCAF6Q58WW2 860 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 WDR49Q8IV35 697 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TNS4Q8IZW8 715 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 COG8Q96MW5 612 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 KPNA7A9QM74 516 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CSPG5O95196 566 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 DCKP27707 260 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 GMPRP36959 345 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MTX3Q5HYI7 312 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 FAM47BQ8NA70 645 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TFAP2CQ92754 450 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 NEMP1O14524 444 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM13O60858 407 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CD19P15391 556 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CDH3P22223 829 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 PTK2BQ14289 1009 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MOGQ16653 247 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 RAB6CQ53S08 254 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 OGFOD2Q6N063 350 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TERB1Q8NA31 727 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 CNPY3Q9BT09 278 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SNX15Q9NRS6 342 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.3■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SULT1C4O75897 302 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MLNP12872 115 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 UGT1A6P19224 532 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 UGT1A1P22309 533 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 UGT1A4P22310 534 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 FGFR3P22607 806 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TTKP33981 857 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 UGT1A3P35503 534 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 UGT1A5P35504 534 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 ASPAP45381 313 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 AGR3Q8TD06 166 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM17Q9Y577 477 aa22.29■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 PRPSAP2O60256 369 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MAP3K6O95382 1288 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 STAMBPO95630 424 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN5-201ENST00000403084 MPSTP25325 297 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms