RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS13P62277 151 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 VAMP2P63027 116 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GHRHRQ02643 423 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFHR1Q03591 330 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNDQ07001 517 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALNT3Q14435 633 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBWD5Q5RIA9 395 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf76Q5T2E6 689 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF793Q6ZN11 406 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 BBS12Q6ZW61 710 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF144BQ7Z419 303 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMTC1Q8IUR5 882 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRSK2Q8IWQ3 736 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDB2Q92466 427 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAMQ92783 540 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCNM1Q9BWG6 230 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR63Q9BZJ6 419 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACAD9Q9H845 621 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNRD2Q9NNW7 524 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLXIPLQ9NP71 852 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A11Q9NSA0 550 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGA3Q9NZ52 723 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO4Q9UKT5 387 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFSF13BQ9Y275 285 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 DTX4Q9Y2E6 619 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYL1Q9Y2S2 319 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPPA5A6NC42 116 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf65A6NEN9 183 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 F8W810 466 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 HBP1O60381 514 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAR3O75815 825 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TYK2P29597 1187 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 AVPR2P30518 371 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPA2P48052 419 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 STIM1Q13586 685 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGM5Q15124 567 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC18B1Q6NT16 456 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTFR2Q6P444 385 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 LVRNQ6Q4G3 990 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM57BQ71RH2 274 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYB5R4Q7L1T6 521 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK8Q86SG6 692 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRF4Q8IZF3 695 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESX1Q8N693 406 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXD3Q8N9H8 876 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2CD4CQ8TF44 421 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 IP6K1Q92551 441 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 EVI5LQ96CN4 794 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNFT2Q96EX2 444 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MASTLQ96GX5 879 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTDSP1Q9GZU7 261 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MROH8Q9H579 483 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRIP3Q9NQ35 241 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 WASH6PQ9NQA3 447 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM160Q9NX00 188 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPB1Q9UBR1 384 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD207Q9UJ71 328 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC13A4Q9UKG4 626 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSF4Q9ULV5 492 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GVC2 190 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM247A6NEH6 219 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNJ18B7U540 433 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 E5RJQ4 531 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 MASP2O00187 686 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHODO00212 210 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 STRNO43815 780 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGDHO60701 494 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLA-DQA2P01906 255 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARSAP15289 507 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms