RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL11AQ9H165 835 aa15.2■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.19■□□□□ 0.02
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIPK4P57078 832 aa15.19■□□□□ 0.02
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.17■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METP08581 1390 aa15.17■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLKQ9UBT6 870 aa15.16■□□□□ 0.02
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.15■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NME9Q86XW9 330 aa15.15■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZMYM3Q14202 1370 aa15.15■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.14■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.14■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGLP35573 1532 aa15.14■□□□□ 0.01
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKAR2BP31323 418 aa15.13■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRB2O60241 1585 aa15.13■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.13■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.13■□□□□ 0.01
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.13■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC24BO95487 1268 aa15.12■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.12■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM27P14373 513 aa15.12■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED14O60244 1454 aa15.11■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUTM2FA1L443 756 aa15.11■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.11■□□□□ 0.01
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCHSD2O94868 740 aa15.1■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEFMP07197 916 aa15.1■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.1■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.1■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.1■□□□□ 0.01
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.07■□□□□ 0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLC1Q96QB1 1528 aa15.07■□□□□ 0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.05■□□□□ 0
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LTKP29376 864 aa15.04■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AAMPQ13685 434 aa15.04■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPYL6Q8N831 410 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFE2L2Q16236 605 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPS1P31327 1500 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM83GA6ND36 823 aa15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOX12O15370 315 aa15.02■□□□□ -0
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCTN1Q14203 1278 aa15.02□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.02□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.02□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.01□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.99□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VAMP4O75379 141 aa14.99□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBIPQ9NS73 344 aa14.99□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.99□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIF16BQ96L93 1317 aa14.98□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFKBIBQ15653 356 aa14.98□□□□□ -0.01
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