RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577760.1

RPL23-208, Transcript of ribosomal protein L23, human

Gene RPL23, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL23-208	ENST00000577760	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	NOS1	P29475	1434 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	KIF2C	Q99661	725 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	DDIT3	P35638	169 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	GGT6	Q6P531	493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	SNX21	Q969T3	373 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	TRPM2	O94759	1503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	PKP1	Q13835	747 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	PLCH2	O75038	1416 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	HMOX1	P09601	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	MPND	Q8N594	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RPL23-208	ENST00000577760	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	TPM2	P07951	284 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	EVC2	Q86UK5	1308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	CDC45	O75419	566 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	OFD1	O75665	1012 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	ABCC1	P33527	1531 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	SYCE3	A1L190	88 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	FYB1	O15117	783 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPL23-208	ENST00000577760	PTMS	P20962	102 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760		A0A1W2PP64	1363 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	UQCRH	P07919	91 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	VAMP4	O75379	141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	FAM83G	A6ND36	823 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	TET3	O43151	1660 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPL23-208	ENST00000577760	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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