RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 A0A1W2PP64 1363 aa35.49■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.47■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.47■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.46■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 ANP32CO43423 234 aa35.46■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.46■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 POTEAQ6S8J7 498 aa35.45■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 MIER1Q8N108 512 aa35.45■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 KIF1AQ12756 1690 aa35.44■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.43■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.43■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.42■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 PSME1Q06323 249 aa35.4■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 ADAMTS2O95450 1211 aa35.39■■■■□ 3.26
SOBP-202ENST00000477448 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.37■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.35■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 ACEP12821 1306 aa35.34■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 C8orf37Q96NL8 207 aa35.34■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.34■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.34■■■■□ 3.25
SOBP-202ENST00000477448 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHG5O94827 1062 aa35.31■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.3■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 AFF2P51816 1311 aa35.29■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.29■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.29■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.28■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 SOCS7O14512 581 aa35.28■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 USP6P35125 1406 aa35.28■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.26■■■■□ 3.24
SOBP-202ENST00000477448 SBNO1A3KN83 1393 aa35.26■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.25■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 NGLY1Q96IV0 654 aa35.25■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 RALBP1Q15311 655 aa35.24■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 NSD2O96028 1365 aa35.24■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 SSH2Q76I76 1423 aa35.22■■■■□ 3.23
SOBP-202ENST00000477448 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
SOBP-202ENST00000477448 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
SOBP-202ENST00000477448 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.18■■■■□ 3.221e-6■■■■□ 22.9
SOBP-202ENST00000477448 FYB1O15117 783 aa35.17■■■■□ 3.22
SOBP-202ENST00000477448 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.16■■■■□ 3.22
SOBP-202ENST00000477448 CCER2I3L3R5 266 aa35.16■■■■□ 3.22
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF10O15013 1369 aa35.14■■■■□ 3.22
SOBP-202ENST00000477448 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.12■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
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SOBP-202ENST00000477448 PIK3C2AO00443 1686 aa35.11■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.11■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 NME9Q86XW9 330 aa35.1■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 ALS2Q96Q42 1657 aa35.1■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 MORC1Q86VD1 984 aa35.09■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 RXRBP28702 533 aa35.08■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.07■■■■□ 3.21
SOBP-202ENST00000477448 USP54Q70EL1 1684 aa35.07■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 PPP2R1AP30153 589 aa35.03■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.02■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.02■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.02■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.01■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 NLRP13Q86W25 1043 aa35.01■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 ABCA3Q99758 1704 aa35.01■■■■□ 3.2
SOBP-202ENST00000477448 CCDC184Q52MB2 194 aa35.01■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 USP31Q70CQ4 1352 aa35■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 FAM83GA6ND36 823 aa34.99■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 COG3Q96JB2 828 aa34.99■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 ABTB2Q8N961 1025 aa34.98■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
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SOBP-202ENST00000477448 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
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SOBP-202ENST00000477448 MRS2Q9HD23 443 aa34.95■■■■□ 3.19
SOBP-202ENST00000477448 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.94■■■■□ 3.18
SOBP-202ENST00000477448 ATRNO75882 1429 aa34.93■■■■□ 3.18
SOBP-202ENST00000477448 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.91■■■■□ 3.18
SOBP-202ENST00000477448 NLRP6P59044 892 aa34.9■■■■□ 3.18
SOBP-202ENST00000477448 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.88■■■■□ 3.17
SOBP-202ENST00000477448 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SOBP-202ENST00000477448 RGS12O14924 1447 aa34.86■■■■□ 3.17
SOBP-202ENST00000477448 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
SOBP-202ENST00000477448 BTG4Q9NY30 223 aa34.85■■■■□ 3.17
SOBP-202ENST00000477448 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.84■■■■□ 3.17
SOBP-202ENST00000477448 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
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