RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 EVC2Q86UK5 1308 aa23.71■■□□□ 1.39
NEFHP1-201ENST00000412845 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 HSCBQ8IWL3 235 aa23.7■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 NSD2O96028 1365 aa23.7■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 GLI2P10070 1586 aa23.69■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.68■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.68■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 GGT6Q6P531 493 aa23.66■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 LNPKQ9C0E8 428 aa23.66■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 DDIT3P35638 169 aa23.65■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A1W2PP64 1363 aa23.65■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.64■■□□□ 1.38
NEFHP1-201ENST00000412845 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 NUCB1Q02818 461 aa23.63■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 RIPK4P57078 832 aa23.63■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 MRE11P49959 708 aa23.62■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCC11Q96J66 1382 aa23.61■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.61■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.61■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.6■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.6■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 IL16Q14005 1332 aa23.59■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 CLCN1P35523 988 aa23.59■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.59■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 SNX21Q969T3 373 aa23.59■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF16BQ96L93 1317 aa23.58■■□□□ 1.37
NEFHP1-201ENST00000412845 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 STK26Q9P289 416 aa23.57■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.57■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 FYB1O15117 783 aa23.57■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF2CQ99661 725 aa23.57■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.56■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.55■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 ASXL2Q76L83 1435 aa23.55■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.54■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.54■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.53■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.53■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 ERBB4Q15303 1308 aa23.52■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.52■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.52■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.52■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCC3O15438 1527 aa23.52■■□□□ 1.36
NEFHP1-201ENST00000412845 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.51■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.51■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.51■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.5■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.49■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 FBLN1P23142 703 aa23.48■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.48■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 MED14O60244 1454 aa23.48■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 GBP4Q96PP9 640 aa23.47■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 PIK3C2BO00750 1634 aa23.47■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 ESPNB1AK53 854 aa23.47■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.46■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.46■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.46■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 PRKAR2BP31323 418 aa23.46■■□□□ 1.35
NEFHP1-201ENST00000412845 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.45■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 TSPYL6Q8N831 410 aa23.45■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 AK9Q5TCS8 1911 aa23.45■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.44■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 IDI1Q13907 227 aa23.44■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 VAMP4O75379 141 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 GCC1Q96CN9 775 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 PRAM1Q96QH2 718 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 FCHSD2O94868 740 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 SSFA2P28290 1259 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.43■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.42■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPRMP28827 1452 aa23.42■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.42■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.41■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.4■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 HMOX1P09601 288 aa23.4■■□□□ 1.34
NEFHP1-201ENST00000412845 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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