RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.32■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.31■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSH2Q76I76 1423 aa21.29■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP6O75581 1613 aa21.29■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.29■■□□□ 1
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABTB2Q8N961 1025 aa21.27■■□□□ 1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.27■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP13Q86W25 1043 aa21.25■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PP64 1363 aa21.24■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTS2O95450 1211 aa21.24■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP19O94966 1318 aa21.22■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.21■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8orf37Q96NL8 207 aa21.21■□□□□ 0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB22O15209 634 aa21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP6P59044 892 aa21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NGLY1Q96IV0 654 aa21.2■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALS2Q96Q42 1657 aa21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.18■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP31Q70CQ4 1352 aa21.18■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSH5O43196 834 aa21.17■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AFF2P51816 1311 aa21.17■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCP02774 474 aa21.16■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.16■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.15■□□□□ 0.98
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.14■□□□□ 0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHG5O94827 1062 aa21.14■□□□□ 0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NME9Q86XW9 330 aa21.12■□□□□ 0.97
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.09■□□□□ 0.97
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.08■□□□□ 0.97
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC7Q96M83 1385 aa21.08■□□□□ 0.96
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FYB1O15117 783 aa21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PANK3Q9H999 370 aa21.07■□□□□ 0.96
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.05■□□□□ 0.96
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.03■□□□□ 0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYOM1P52179 1685 aa21.02■□□□□ 0.96
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHRNA2Q15822 529 aa21.02■□□□□ 0.96
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.01■□□□□ 0.95
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOX12O15370 315 aa20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP54Q70EL1 1684 aa20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC6O95255 1503 aa20.97■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EVA1CP58658 441 aa20.96■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ILDR2Q71H61 639 aa20.96■□□□□ 0.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
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