RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 SMC5Q8IY18 1101 aa23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 PPLO60437 1756 aa23.55■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.54■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.54■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.53■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.53■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 NSD2O96028 1365 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 GGT6Q6P531 493 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 CABP2Q9NPB3 220 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.52■■□□□ 1.36
CNIH3-201ENST00000272133 MRE11P49959 708 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 RICTORQ6R327 1708 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 EVC2Q86UK5 1308 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.51■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 CLCN1P35523 988 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NPATQ14207 1427 aa23.5■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 DDIT3P35638 169 aa23.49■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 LNPKQ9C0E8 428 aa23.49■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 GLI2P10070 1586 aa23.48■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.47■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 NUCB1Q02818 461 aa23.47■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC11Q96J66 1382 aa23.46■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CNIH3-201ENST00000272133 A0A1W2PP64 1363 aa23.45■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 RIPK4P57078 832 aa23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 SNX21Q969T3 373 aa23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.44■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 KIF16BQ96L93 1317 aa23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC3O15438 1527 aa23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 IL16Q14005 1332 aa23.42■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.42■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 DIP2BQ9P265 1576 aa23.41■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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CNIH3-201ENST00000272133 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 ERBB4Q15303 1308 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.4■■□□□ 1.34
CNIH3-201ENST00000272133 KIF2CQ99661 725 aa23.4■■□□□ 1.34
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CNIH3-201ENST00000272133 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.38■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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CNIH3-201ENST00000272133 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ESPNB1AK53 854 aa23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 GBP4Q96PP9 640 aa23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 FYB1O15117 783 aa23.36■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.36■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 STK26Q9P289 416 aa23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.35■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.34■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CNIH3-201ENST00000272133 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 MED14O60244 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.32■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 GCC1Q96CN9 775 aa23.29■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 SSFA2P28290 1259 aa23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.28■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 PIK3C2BO00750 1634 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 PRKAR2BP31323 418 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.27■■□□□ 1.32
CNIH3-201ENST00000272133 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CNIH3-201ENST00000272133 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.26■■□□□ 1.31
CNIH3-201ENST00000272133 FBLN1P23142 703 aa23.25■■□□□ 1.31
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