RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CD151	P48509	253 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HPCA	P84074	193 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CARTPT	Q16568	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	COX4I1	P13073	169 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	UQCRB	P14927	111 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	USP4	Q13107	963 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM73	Q86UV7	250 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	APBA2	Q99767	749 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DPY30	Q9C005	99 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	AFF2	P51816	1311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SPTLC1	O15269	473 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K13	O43283	966 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	VDR	P11473	427 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MUT	P22033	750 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CDK7	P50613	346 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	BNIP1	Q12981	228 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	LPIN1	Q14693	890 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXO30	Q8TB52	745 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PPM1	405 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PLA2G6	O60733	806 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL18	O94889	574 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RBL1	P28749	1068 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PRKCI	P41743	596 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	BROX	Q5VW32	411 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ALG3	Q92685	438 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FICD	Q9BVA6	458 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NID2	Q14112	1375 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A0B4J269	797 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KATNA1	O75449	491 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	BANF1	O75531	89 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PDE9A	O76083	593 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MYL4	P12829	197 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	GART	P22102	1010 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PSME3	P61289	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CBX3	Q13185	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	BHMT	Q93088	406 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM200B-223	ENST00000622362	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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