RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IPP	Q9Y573	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABCB11	O95342	1321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ITGB4	P16144	1822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD14	O00487	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LAD1	O00515	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPHP1	O15259	732 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPAA1	O43292	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STARD3NL	O95772	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPS	P0C0P6	89 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAL	P21145	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CALML3	P27482	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADD2	P35612	726 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PBX1	P40424	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPS15	P42566	896 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA9	P43362	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STIM1	Q13586	685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNB1	Q14721	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RITA1	Q96K30	269 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525		K7ESF4	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT86	O43790	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYL6B	P14649	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL1R2	P27930	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GNAQ	P50148	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TIMM10	P62072	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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