RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928		A8MUI8	341 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DCLK1	O15075	740 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TOMM70	O94826	608 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CPOX	P36551	454 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	AP2B1	P63010	937 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KRT3	P12035	628 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PSMA2	P25787	234 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MGAT3	Q09327	533 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ASPH	Q12797	758 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC14	Q15048	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TBCB	Q99426	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NDST1	P52848	882 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NUP107	P57740	925 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CREB5	Q02930	508 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	EMC1	Q8N766	993 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	UPP2	O95045	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ITGB3	P05106	788 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OCM2	P0CE71	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	INHBC	P55103	352 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GPS1	Q13098	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	METTL18	O95568	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	BAG2	O95816	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HMOX2	P30519	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SSTR1	P30872	391 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HOXC13	P31276	330 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	RSAD1	Q9HA92	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928		A0A087WZ62	844 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CST8	O60676	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ESRRG	P62508	458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GSTM4	Q03013	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PDK2	Q15119	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FXN	Q16595	210 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	COQ7	Q99807	217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TEX28	O15482	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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