RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MARK1Q9P0L2 795 aa6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PLXNA2O75051 1894 aa6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PIK3R2O00459 728 aa6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 AP2A1O95782 977 aa6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF567Q8N184 647 aa6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 VPS52Q8N1B4 723 aa6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.62□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.62□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 MAGEA4P43358 317 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 DNA2P51530 1060 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 EPHB3P54753 998 aa6.61□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 GPS1Q13098 491 aa6.61□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.61□□□□□ -1.35
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PRKCI-202ENST00000476635 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ALG14Q96F25 216 aa6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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