RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 L1CAMP32004 1257 aa9.05□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 SYT15Q9BQS2 421 aa9.05□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TLE6Q9H808 572 aa9.05□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.05□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 DNAJB1P25685 340 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 INPP5AQ14642 412 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 KIF19Q2TAC6 998 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF333Q96JL9 665 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 SYBUQ9NX95 663 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 EURLQ9NYK6 297 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 USP1O94782 785 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 PMLP29590 882 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 HTR7P34969 479 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 MAP3K7CLP57077 242 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEP78395 509 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 CGB2Q6NT52 195 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 C2orf69Q8N8R5 385 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 C12orf29Q8N999 325 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 URGCPQ8TCY9 931 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 P2RY11Q96G91 374 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 FZD1Q9UP38 647 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ENO4A6NNW6 628 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PLIN3O60664 434 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 FAM155BO75949 473 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 GJB1P08034 283 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 C16orf46Q6P387 395 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 IPMKQ8NFU5 416 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 S100A14Q9HCY8 104 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 SNX15Q9NRS6 342 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 KLK14Q9P0G3 267 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 COPG2Q9UBF2 871 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 LTBP1Q14766 1721 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 IL10P22301 178 aa9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 SIK2Q9H0K1 926 aa9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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HERC3-201ENST00000264345 MEI4A8MW99 385 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-10P10266 1014 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 CD151P48509 253 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 MTA1Q13330 715 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 MFSD10Q14728 455 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 PQLC3Q8N755 202 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 CXorf38Q8TB03 319 aa9.03□□□□□ -0.96
HERC3-201ENST00000264345 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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