RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 Q3C1V9 767 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 DSELQ8IZU8 1212 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 RNF157Q96PX1 679 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 NUF2Q9BZD4 464 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 RRN3Q9NYV6 651 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PIK3R1P27986 724 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ACADVLP49748 655 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MTA1Q13330 715 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDK1Q15118 436 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CYTH1Q15438 398 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RNF149Q8NC42 400 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 COPS5Q92905 334 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CNDP1Q96KN2 507 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CDRT15Q96T59 188 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MED7O43513 233 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PRKCGP05129 697 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GLDCP23378 1020 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MYL6P60660 151 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 STEAP4Q687X5 459 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ILDR2Q71H61 639 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SNX32Q86XE0 403 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 WDR49Q8IV35 697 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PLD5Q8N7P1 536 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CDKL2Q92772 493 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF711Q9Y462 761 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 WDR90Q96KV7 1748 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MSCO60682 206 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CNMDO75829 334 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ALDH1A2O94788 518 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RAB15P59190 212 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CPXM1Q96SM3 734 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SOCS7O14512 581 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 APOL1O14791 398 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 H6PDO95479 791 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ERBB2P04626 1255 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CD19P15391 556 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SERPINB5P36952 375 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TUBA4AP68366 448 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 NAB1Q13506 487 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 DPYSQ14117 519 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PPP2R5DQ14738 602 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 METTL7BQ6UX53 244 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 A0A1B0GTW7 788 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SLC22A2O15244 555 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 HSPA4LO95757 839 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 BCAR1P56945 870 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RIN3Q8TB24 985 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 VPS50Q96JG6 964 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ME2P23368 584 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SPIDRQ14159 915 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC153Q494R4 210 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms