RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	OPHN1	O60890	802 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CP	P00450	1065 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	APOE	P02649	317 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	HCAR3	P49019	387 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CDK7	P50613	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	DPF3	Q92784	378 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SENP1	Q9P0U3	644 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	INHBA	P08476	426 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PYGB	P11216	843 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SELP	P16109	830 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MGAT1	P26572	445 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	BMPR2	Q13873	1038 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	C4orf22	Q6V702	233 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SCML4	Q8N228	414 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PHF24	Q9UPV7	400 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PAGE1	O75459	146 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TADA2A	O75478	443 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SLC18A1	P54219	525 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	IL9R	Q01113	521 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	URGCP	Q8TCY9	931 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CASD1	Q96PB1	797 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MARCH5	Q9NX47	278 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SPAG6	O75602	509 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	KIAA0754	O94854	1291 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	FDFT1	P37268	417 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MGAT5	Q09328	741 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	GALNT2	Q10471	571 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PARP6	Q2NL67	630 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SCLY	Q96I15	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	EPAS1	Q99814	870 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	FAM159B	A6NKW6	160 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	VNN2	O95498	520 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TBX18	O95935	607 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MT-ND3	P03897	115 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ARPP19	P56211	112 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	MTFR1	Q15390	333 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	PDK4	Q16654	411 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	C14orf80	Q86SX3	495 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TLE3-213	ENST00000558379	CNTD1	Q8N815	330 aa		12.84	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms