RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517194.1

RNU6-1261P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1261, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1261P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRPH2P23942 346 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 AVPR2P30518 371 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TSPAN7P41732 249 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF84P51523 738 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 B4GALNT1Q00973 533 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GALNT2Q10471 571 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC14A1Q13336 389 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TDGQ13569 410 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GPR162Q16538 588 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NFIL3Q16649 462 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MTFR2Q6P444 385 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 VSTM1Q6UX27 236 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 VPS52Q8N1B4 723 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CAGE1Q8TC20 777 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RNF125Q96EQ8 232 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MASTLQ96GX5 879 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TAOK3Q9H2K8 898 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ASB6Q9NWX5 421 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 KLQ9UEF7 1012 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 BTBD19C9JJ37 291 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 H7C1Q1 480 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CNTN5O94779 1100 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TBX18O95935 607 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ARSAP15289 507 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TNFRSF1AP19438 455 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PRKCHP24723 683 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CACNA2D1P54289 1103 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CASP6P55212 293 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GPR68Q15743 365 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 LCE4AQ5TA78 99 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 Q8N1X5 172 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RNFT2Q96EX2 444 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 APOPT1Q96IL0 206 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 HIC2Q96JB3 615 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 UROC1Q96N76 676 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TIMP4Q99727 224 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DUSP26Q9BV47 211 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TRIM2Q9C040 744 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 NUAK2Q9H093 628 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MROH8Q9H579 483 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SUFUQ9UMX1 484 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TARM1B6A8C7 271 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SMIM22K7EJ46 135 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DSCR3O14972 297 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SYN3O14994 580 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 C6P13671 934 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TACR2P21452 398 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ABCD3P28288 659 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GGT5P36269 586 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RXRGP48443 463 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 MVDP53602 400 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 SOX10P56693 466 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ARHGAP8P85298 464 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 DMWDQ09019 674 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 BAK1Q16611 211 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 RANBP10Q6VN20 620 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1261P-201ENST00000517194 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms