RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454		M0QYT0	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	INPPL1	O15357	1258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SEPT4	O43236	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	BCAR3	O75815	825 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CD63	P08962	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GRK5	P34947	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	VPS41	P49754	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PRY	O14603	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	AGR2	O95994	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CYP3A4	P08684	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CNTF	P26441	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PCP4	P48539	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TLE2	Q04725	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TLE3	Q04726	772 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SEC23B	Q15437	767 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PIGK	Q92643	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PIGS	Q96S52	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GVC2	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454		E5RJQ4	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SGPL1	O95470	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PLAU	P00749	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	POLB	P06746	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CD53	P19397	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MMP13	P45452	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	AGTR2	P50052	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	UBE3A	Q05086	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PDCL	Q13371	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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