RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354749.6

TTC3-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC3, Length 9,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-201ENST00000354749 IRF1P10914 325 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 SLC2A4P14672 509 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 RXRBP28702 533 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 CPT1AP50416 773 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 SEC23AQ15436 765 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 TTC23Q5W5X9 447 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 SV2AQ7L0J3 742 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 163.7
TTC3-201ENST00000354749 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 MYDGFQ969H8 173 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 APOL2Q9BQE5 337 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 AHSPQ9NZD4 102 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 CDH9Q9ULB4 789 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC3-201ENST00000354749 H7C4K7 107 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 CCR1P32246 355 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 FLT3P36888 993 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 RHOAP61586 193 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ST3GAL1Q11201 340 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PHKG1Q16816 387 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PALB2Q86YC2 1186 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 C4orf19Q8IY42 314 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ELP3Q9H9T3 547 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 EPB42P16452 691 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PRKCIP41743 596 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ACAP1Q15027 740 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PDK4Q16654 411 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ATG4CQ96DT6 458 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ACOX2Q99424 681 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 DNAJC18Q9H819 358 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 NT5MQ9NPB1 228 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 VPS28Q9UK41 221 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 VAV3Q9UKW4 847 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 TAF4O00268 1085 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 RAP1GAPP47736 663 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 FAAP100Q0VG06 881 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 BNIP2Q12982 314 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 AMER2Q8N7J2 671 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 S100ZQ8WXG8 99 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ART4Q93070 314 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 SERPINF2P08697 491 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ZNF276Q8N554 614 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PADI4Q9UM07 663 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 RAD51BO15315 384 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ENTPD5O75356 428 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ALOX5P09917 674 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 LHX1P48742 406 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 SLC26A2P50443 739 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 POU6F1Q14863 301 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PDIA6Q15084 440 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 PMF1Q6P1K2 205 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 MIB1Q86YT6 1006 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 KLHL1Q9NR64 748 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 GGA3Q9NZ52 723 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 AK5Q9Y6K8 562 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 NWD1Q149M9 1564 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 CLUHO75153 1309 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 COX4I1P13073 169 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 KCNJ2P63252 427 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ITGADQ13349 1161 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 AMHR2Q16671 573 aa6.64□□□□□ -1.35
TTC3-201ENST00000354749 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms