RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 RAB17Q9H0T7 212 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 WASH4PA8MWX3 477 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 F5H5T6 163 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 AVPR1AP37288 418 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LZTR1Q8N653 840 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 WBP2Q969T9 261 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PNKPQ96T60 521 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DONSONQ9NYP3 566 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DRGXA6NNA5 263 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 H7C0C1 242 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GREM1O60565 184 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RHOQP17081 205 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ATP5OP48047 213 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZXDBP98169 803 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R7Q15435 360 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 C5orf22Q49AR2 442 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ADGRF1Q5T601 910 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 Q6ZNB5 142 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ALLCQ8N6M5 410 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 HACD1B0YJ81 288 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NCAM2O15394 837 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MCM3P25205 808 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 SLC6A4P31645 630 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GUCY2DQ02846 1103 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PDK1Q15118 436 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 WDR93Q6P2C0 686 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NLRP14Q86W24 1093 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 LGI2Q8N0V4 545 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NPWQ8N729 165 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ERP44Q9BS26 406 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 MPP6Q9NZW5 540 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC71-201ENST00000321895 NUP205Q92621 2012 aa20.27■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP69A5D8W1 941 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 LINC01565O15544 149 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K6O95382 1288 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CEBPBP17676 345 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PTK6Q13882 451 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HTR3DQ70Z44 454 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GPR149Q86SP6 731 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 IFT20Q8IY31 132 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SEC14L1Q92503 715 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 IGSF8Q969P0 613 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RAB21Q9UL25 225 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CDH23Q9H251 3354 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SGK1O00141 431 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 LEFTY2O00292 366 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 MX2P20592 715 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ADAM15Q13444 863 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 KLC2Q9H0B6 622 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GDF3Q9NR23 364 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 DYNC1I1O14576 645 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 IRAK1P51617 712 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 DUPD1Q68J44 220 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC89Q8N998 374 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms