RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 O00370 1275 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PSTPIP1O43586 416 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 OR4Q2P0C623 313 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 GALK1P51570 392 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 NDST1P52848 882 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 HDXQ7Z353 690 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PIP4P1Q86T03 277 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 ITIH5Q86UX2 942 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 IFT20Q8IY31 132 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOC4Q96A65 974 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 MIS12Q9H081 205 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 EBF3Q9H4W6 596 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.78■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 SETSIPP0DME0 302 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 SV2CQ496J9 727 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 DPH6Q7L8W6 267 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 PIGKQ92643 395 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.77■□□□□ 0.92
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM170AA1A519 330 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 OR6C75A6NL08 312 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 M0QZQ0 153 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC25CP30307 473 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 GPD2P43304 727 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MARCKSL1P49006 195 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TAF6P49848 677 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP4F8P98187 520 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC38Q5VT99 294 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 C18orf8Q96DM3 657 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.76■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 PPEF2O14830 753 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 PYGMP11217 842 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 PI4KAP42356 2102 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SEMA3BQ13214 749 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP1B1Q16678 543 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM7Q9C029 511 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MTMR11A4FU01 709 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 KPNA7A9QM74 516 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 RAD51CO43502 376 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 BCKDHBP21953 392 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MAPK8P45983 427 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SCAPQ12770 1279 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 NNTQ13423 1086 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 C2CD6Q53TS8 623 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 EMBQ6PCB8 327 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 GCNAQ96QF7 691 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM187AA6NFU0 413 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms