RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PMS2P54278 862 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 WASHC5Q12768 1159 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 NAB1Q13506 487 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 COL19A1Q14993 1142 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 EPAS1Q99814 870 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM72CH0Y354 149 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ADAM12O43184 909 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MFSD11O43934 449 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TTC4O95801 387 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NCAM1P13591 858 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RAG1P15918 1043 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CLCN4P51793 760 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 COG7P83436 770 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PARP6Q2NL67 630 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MPP7Q5T2T1 576 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GALNT7Q86SF2 657 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FAM72BQ86X60 149 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HSPH1Q92598 858 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 EXOC4Q96A65 974 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB12Q96P63 405 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZIM3Q96PE6 472 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 WDCPQ9H6R7 721 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MKS1Q9NXB0 559 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GMIPQ9P107 970 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.65□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 OPA1O60313 960 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SIN3BO75182 1162 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RBP3P10745 1247 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF844Q08AG5 666 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ITIH5Q86UX2 942 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCNJLQ8IV13 435 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HASPINQ8TF76 798 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ISL2Q96A47 359 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CENPTQ96BT3 561 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 RANBP9Q96S59 729 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 H3BQF6 201 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GRAP2O75791 330 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FGF18O76093 207 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LRIG2O94898 1065 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ADRA1AP35348 466 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GPR15P49685 360 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 ATP11AP98196 1134 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 FIBCD1Q8N539 461 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRKCI-202ENST00000476635 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms