RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 PLLPQ9Y342 182 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM63AO94886 807 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ATG7O95352 703 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 WEE1P30291 646 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 MAGEA3P43357 314 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 NAMPTP43490 491 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 KCNJ8Q15842 424 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 GPR162Q16538 588 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 PCSK7Q16549 785 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 SIX5Q8N196 739 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 CALML6Q8TD86 181 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 CSRNP1Q96S65 589 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 NDE1Q9NXR1 346 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 TCP10Q12799 353 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CDC16Q13042 620 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 DOK7Q18PE1 504 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 ACER1Q8TDN7 264 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CFL2Q9Y281 166 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.47□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 NOMO1Q15155 1222 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF410Q86VK4 478 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 PALM2Q8IXS6 379 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TTC9Q92623 222 aa6.46□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SERAC1Q96JX3 654 aa6.46□□□□□ -1.37
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