RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.53□□□□□ -0.08
GGA3-216ENST00000583282 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 F5H5T6 163 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CYBBP04839 570 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TCF4P15884 667 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 MIPP30301 263 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ZXDAP98168 799 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 KDSRQ06136 332 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ADGRF1Q5T601 910 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 C12orf40Q86WS4 652 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SIX5Q8N196 739 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 P2RY11Q96G91 374 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ZWILCHQ9H900 591 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 STIM2Q9P246 746 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.52□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 PRPSAP2O60256 369 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TBL1XO60907 577 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 PROSCO94903 275 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ENDOD1O94919 500 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CTHP32929 405 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CHKAP35790 457 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 IRAK1P51617 712 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 EFHC2Q5JST6 749 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CPXM2Q8N436 756 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 NAT16Q8N8M0 369 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 DDI1Q8WTU0 396 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.51□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 KRBA1A5PL33 1030 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 MTA2O94776 668 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CCDC175P0C221 793 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TNNT1P13805 278 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TYRP14679 529 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CD72P21854 359 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 IL1R2P27930 398 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 GJA4P35212 333 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 GAD2Q05329 585 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 KIF5AQ12840 1032 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 NR1H3Q13133 447 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 GAB4Q2WGN9 574 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 FYB2Q5VWT5 728 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 C14orf80Q86SX3 495 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 HSPH1Q92598 858 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 NTAN1Q96AB6 310 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 CHFRQ96EP1 664 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 FZD10Q9ULW2 581 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 USP18Q9UMW8 372 aa14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 E9PAM4 449 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 TNFRSF10AO00220 468 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SPOPO43791 374 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 SRGAP2O75044 1071 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 MOCS3O95396 460 aa14.49□□□□□ -0.09
GGA3-216ENST00000583282 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms