RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLI1	P08151	1106 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP11B1	P15538	503 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKCH	P24723	683 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPL	P40238	635 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF445	P59923	1031 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF234	Q14588	700 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBL1X	O60907	577 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRAP2	O75791	330 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBD3	O95983	291 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C7	P10643	843 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GBP1	P32455	592 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD70	P32970	193 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC11A2	P49281	568 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	JAM2	P57087	298 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELF2	Q15723	593 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	STX1A	Q16623	288 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPRN	Q16849	979 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUT11	Q495W5	492 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN9	O14815	690 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPC1	O15118	1278 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSF2BP	O75031	334 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT9	P35527	623 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTGER3	P43115	390 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABRB2	P47870	512 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	COPA	P53621	1224 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYL5	Q02045	173 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CREB5	Q02930	508 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TYRO3	Q06418	890 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGBD3	Q8N328	593 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYO19	Q96H55	970 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM245	Q9H330	911 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GGA2	Q9UJY4	613 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM170A	A1A519	330 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A4	O14863	429 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TM4SF5	O14894	197 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMM44	O43615	452 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAB1	O75553	588 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAVIN2	O95810	425 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MME	P08473	750 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-E	P13747	358 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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