RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, human

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLTC-208	ENST00000496076	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	FRS3	O43559	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	NDUFS1	P28331	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	PBX1	P40424	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	RFX2	P48378	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	GAD2	Q05329	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	CDH19	Q9H159	772 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	KIF3B	O15066	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	GNAL	P38405	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLTC-208	ENST00000496076	LINC01565	O15544	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ZNF432	O94892	652 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	IFNA2	P01563	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	HOXC6	P09630	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	AKR1A1	P14550	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	WBP1	Q96G27	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	CIITA	P33076	1130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	AGTR2	P50052	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	HILS1	P60008	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	PMM1	Q92871	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	CAND2	O75155	1236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	MATN1	P21941	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	STAT6	P42226	847 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	RHBDL3	P58872	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	DMWD	Q09019	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	BFSP2	Q13515	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ELF2	Q15723	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	RFPL1	O75677	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	SGPL1	O95470	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	MT-ND5	P03915	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	WNT1	P04628	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	CPA1	P15085	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	DRD1	P21728	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLTC-208	ENST00000496076	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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