RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 ENPP2Q13822 863 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 DCAF6Q58WW2 860 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 CEP83Q9Y592 693 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 TBL1XO60907 577 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 HSF2BPO75031 334 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 TPM2P07951 284 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 NDUFV2P19404 249 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 MPLP40238 635 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 IL12RB1P42701 662 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB106AQ8N104 65 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.533e-6■■■□□ 16.3
HOXB3-202ENST00000460160 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 SPACA7Q96KW9 195 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 CIPCQ9C0C6 399 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-202ENST00000460160 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 GRAP2O75791 330 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF806P0C7X5 589 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF18P17022 549 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 TYRO3Q06418 890 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF234Q14588 700 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 NCAPHQ15003 741 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SYNCQ9H7C4 482 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 EPHB6O15197 1021 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 TIMM44O43615 452 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 APOEP02649 317 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SNX16P57768 344 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 CREB5Q02930 508 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 TAF3Q5VWG9 929 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 ADIPOR2Q86V24 386 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SLC6A17Q9H1V8 727 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 GGA2Q9UJY4 613 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 CDK17Q00537 523 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SLC6A3Q01959 620 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 FUT11Q495W5 492 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 CHST9Q7L1S5 443 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 MRGPRX1Q96LB2 322 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 STIM2Q9P246 746 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 LGALS16A8MUM7 142 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 GDF9O60383 454 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 DAB1O75553 588 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 CD70P32970 193 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 JAM2P57087 298 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 STARD3Q14849 445 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 E2F5Q15329 346 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 LMLNQ96KR4 655 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 VPS45Q9NRW7 570 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 DDIT4Q9NX09 232 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 MAP3K13O43283 966 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 SDHBP21912 280 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 PRKCHP24723 683 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms