RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	P2RY2	P41231	377 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	IL12RB1	P42701	662 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CDK17	Q00537	523 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	STARD3	Q14849	445 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	RNF34	Q969K3	372 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC39A13	Q96H72	371 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	GFRA2	O00451	464 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	IRAK2	O43187	625 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	HSF2BP	O75031	334 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	GFPT2	O94808	682 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	NDUFV2	P19404	249 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	ARHGAP8	P85298	464 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF234	Q14588	700 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	PMS2CL	Q68D20	193 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM215	Q68D42	235 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CHST9	Q7L1S5	443 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	AZIN2	Q96A70	460 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	GAN	Q9H2C0	597 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	DDIT4	Q9NX09	232 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	GGA2	Q9UJY4	613 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	GLI1	P08151	1106 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CHSY1	Q86X52	802 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	MFN1	Q8IWA4	741 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	THADA	Q6YHU6	1953 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FAAP20-210	ENST00000440825	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC6A3	Q01959	620 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	UBXN1	Q04323	297 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	NME3	Q13232	169 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	SYCP1	Q15431	976 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	LGI2	Q8N0V4	545 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	EPHB6	O15197	1021 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	TIMM44	O43615	452 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	GDF9	O60383	454 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	MME	P08473	750 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	CD70	P32970	193 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	E2F5	Q15329	346 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	FUT11	Q495W5	492 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	ERICH1	Q86X53	443 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	AHI1	Q8N157	1196 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	DEFB119	Q8N690	84 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	SPAG5	Q96R06	1193 aa		28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	LGALS16	A8MUM7	142 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	NPC1	O15118	1278 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	CAVIN2	O95810	425 aa		28.74	■■■□□ 2.19
FAAP20-210	ENST00000440825	IGLV3-25	P01717	112 aa		28.74	■■■□□ 2.19

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