RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE1BQ01064 536 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PPTC7Q8NI37 304 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PANX3Q96QZ0 392 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 LGMNQ99538 433 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SNTG2Q9NY99 539 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 EMCNQ9ULC0 261 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PLIN3O60664 434 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 OPHN1O60890 802 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF286BP0CG31 522 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ADORA2AP29274 412 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CRADDP78560 199 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF410Q86VK4 478 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT82Q9NSB4 513 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 USP3Q9Y6I4 520 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 F5H423 210 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ITM2AO43736 263 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINE1P05121 402 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ANPEPP15144 967 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GRK2P25098 689 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SULF1Q8IWU6 871 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 UCMAQ8WVF2 138 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GPAMQ9HCL2 828 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC130P13994 396 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNA4P22459 653 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MGAT1P26572 445 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PEX19P40855 299 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB6Q15916 424 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 INSCQ1MX18 579 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX27Q96L92 541 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 UPP2O95045 317 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ITGA2BP08514 1039 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PDGFRBP09619 1106 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC17A6Q9P2U8 582 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FZD10Q9ULW2 581 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 H3BRB1 525 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 TUBB3Q13509 450 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 HIC1Q14526 733 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM131BQ86XD5 332 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 P2RY11Q96G91 374 aa22.1■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 ADM5C9JUS6 153 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FKBP6O75344 327 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC189A1A4V9 331 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEA13PA6NCF6 341 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 TYK2P29597 1187 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CPOXP36551 454 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GLUD2P49448 558 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PSEN1P49768 467 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PCLAFQ15004 111 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.09■■□□□ 1.13
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