RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637919.1

PLCB1-233, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PLCB1, Length 5,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-233	ENST00000637919	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	GPC4	O75487	556 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	APOA4	P06727	396 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	RPA1	P27694	616 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	NUDT2	P50583	147 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	DLG1	Q12959	904 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	NAB1	Q13506	487 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	NPY5R	Q15761	445 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	SNAP91	O60641	907 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	TNNC2	P02585	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	IL12A	P29459	219 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	TM4SF4	P48230	202 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	GSS	P48637	474 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	BNC1	Q01954	994 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	STARD8	Q92502	1023 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	COQ7	Q99807	217 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919		H7C0C1	242 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919		M0R3G1	203 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	PIK3R2	O00459	728 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CXCL11	O14625	94 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	AIM2	O14862	343 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CYP26A1	O43174	497 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	TYROBP	O43914	113 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.49	□□□□□ -1.69	5e-6	■■□□□ 11.9
PLCB1-233	ENST00000637919	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	RALB	P11234	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	COX4I1	P13073	169 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	GTF2H1	P32780	548 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP5O	P48047	213 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	STXBP2	Q15833	593 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	DGUOK	Q16854	277 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PLCB1-233	ENST00000637919	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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