RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576335.5

TRAP1-216, Transcript of TNF receptor associated protein 1, human

TSL 5

Gene TRAP1, Length 645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAP1-216	ENST00000576335	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ING5	Q8WYH8	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	LEFTY2	O00292	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ECI2	O75521	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	LAMP2	P13473	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ADRA1B	P35368	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	RWDD2B	P57060	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	GNG11	P61952	73 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CLUL1	Q15846	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZNF77	Q15935	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CD101	Q93033	1021 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	EPAS1	Q99814	870 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	MYO7A	Q13402	2215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ACSL4	O60488	711 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	FTCD	O95954	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	L1CAM	P32004	1257 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ARL4A	P40617	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	COPS2	P61201	443 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335		Q6ZNB5	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ESPN	B1AK53	854 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335		F5H5T6	163 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335		H3BRJ5	948 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CES2	O00748	559 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PAGE1	O75459	146 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAP1-216	ENST00000576335	CYBB	P04839	570 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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