RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRF1-209ENST00000547052 KIAA1328Q86T90 577 aa18.55■□□□□ 0.56
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BRF1-209ENST00000547052 PIGVQ9NUD9 493 aa18.55■□□□□ 0.56
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BRF1-209ENST00000547052 DEC1Q9P2X7 70 aa18.55■□□□□ 0.56
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