RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 DHCR24Q15392 516 aa17.09■□□□□ 0.33
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PACSIN3-210ENST00000533686 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF34Q969K3 372 aa17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGEF26Q96DR7 871 aa17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3-210ENST00000533686 MSANTD3Q96H12 275 aa17.09■□□□□ 0.33
PACSIN3-210ENST00000533686 BTN2A3PQ96KV6 586 aa17.09■□□□□ 0.33
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PACSIN3-210ENST00000533686 UVRAGQ9P2Y5 699 aa17.09■□□□□ 0.33
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PACSIN3-210ENST00000533686 C1orf228Q6PIY5 440 aa17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.08■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.08■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 FBXL21Q9UKT6 434 aa17.08■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 CCP110O43303 1012 aa17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 PSMA2P25787 234 aa17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 HDAC4P56524 1084 aa17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 ACAP1Q15027 740 aa17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 TCEAL1Q15170 157 aa17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC8AQ8IWT6 810 aa17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 PDLIM2Q96JY6 352 aa17.07■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 TKTL2Q9H0I9 626 aa17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 HEBP1Q9NRV9 189 aa17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.07■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 GJA4P35212 333 aa17.06■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 STARD6P59095 220 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 IER5LQ5T953 404 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 NADSYN1Q6IA69 706 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM25Q86YD3 366 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 HAPLN3Q96S86 360 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM7Q9C029 511 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 IP6K2Q9UHH9 426 aa17.06■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 KRBA1A5PL33 1030 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 MYO1FO00160 1098 aa17.05■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 PAGE1O75459 146 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF8O76064 485 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 MTA2O94776 668 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 CYBBP04839 570 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 CTHP32929 405 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT83P78385 493 aa17.05■□□□□ 0.32
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PACSIN3-210ENST00000533686 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 MPPE1Q53F39 396 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB6CQ53S08 254 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM131BQ86XD5 332 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 SIX5Q8N196 739 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 TTC8Q8TAM2 541 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC35G2Q8TBE7 412 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 RFFLQ8WZ73 363 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 NTAN1Q96AB6 310 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 C1orf74Q96LT6 269 aa17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3-210ENST00000533686 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
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