RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TCHH	Q07283	1943 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A0MRY4	1105 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MSTN	O14793	375 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TULP3	O75386	442 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CLSTN1	O94985	981 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GCNT3	O95395	438 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TERB1	Q8NA31	727 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ANK1	P16157	1881 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QW42	95 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	OLFM2	O95897	454 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPNS1	P04632	268 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF1	P10914	325 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MAOB	P27338	520 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	YWHAQ	P27348	245 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIK2	Q13002	908 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	OBSL1	O75147	1896 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	COCH	O43405	550 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	IDE	P14735	1019 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GAP43	P17677	238 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GART	P22102	1010 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA1	Q09470	495 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP8B3	O60423	1300 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GTW7	788 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQF6	199 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM24	O15164	1050 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CER1	O95813	267 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP15	O95972	392 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	CD6	P30203	668 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB4	P48594	390 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNC1	P63316	161 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD3	Q14849	445 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SURF1	Q15526	300 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM25	Q86YD3	366 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GPD1L	Q8N335	351 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOX2	Q99424	681 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF2C	Q99661	725 aa		11.46	□□□□□ -0.57

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