RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	MYL1	P05976	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	NCAM1	P13591	858 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	KRT13	P13646	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CMA1	P23946	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	COG7	P83436	770 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	NFIL3	Q16649	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DKK1	O94907	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TPMT	P51580	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF132	P52740	706 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF234	Q14588	700 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CACUL1	Q86Y37	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054		A0A1B0GTW7	788 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CYBB	P04839	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PRKCH	P24723	683 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ABCG1	P45844	678 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	COPA	P53621	1224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ENPEP	Q07075	957 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM215	Q68D42	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	UCMA	Q8WVF2	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	ARID3A	Q99856	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	PRORY	Q9H606	182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTSL-205	ENST00000482054	METTL12	A8MUP2	240 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	IGLV3-19	P01714	112 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	OXTR	P30559	389 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	GTF2H1	P32780	548 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	SYK	P43405	635 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	MXI1	P50539	228 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	NDUFA8	P51970	172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	RAD23B	P54727	409 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	DPYD	Q12882	1025 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	ADAM9	Q13443	819 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	KRT39	Q6A163	491 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTSL-205	ENST00000482054	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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