RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	NTAN1	Q96AB6	310 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAF2	Q96CS3	445 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300		H3BRJ5	948 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TLR5	O60602	858 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ITGAV	P06756	1048 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	BMPR1A	P36894	532 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	AIF1	P55008	147 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	TPI1	P60174	286 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ERVFC1	P60507	584 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD9B-204	ENST00000409300	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TGM5	O43548	720 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ARHGEF15	O94989	841 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EPHB2	P29323	1055 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SCAP	Q12770	1279 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PLD1	Q13393	1074 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PTK6	Q13882	451 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CASP8	Q14790	479 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NACA2	Q9H009	215 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	LILRB3	O75022	631 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PAGE1	O75459	146 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	LRIG2	O94898	1065 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CSH1	P0DML2	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CSH2	P0DML3	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TGM2	P21980	687 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PSEN1	P49768	467 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HDX	Q7Z353	690 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TRANK1	O15050	2925 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ERCC2	P18074	760 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJB1	P25685	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	KLRC2	P26717	231 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TBX4	P57082	545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	GPS1	Q13098	491 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	P3H1	Q32P28	736 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	FMO2	Q99518	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	FNIP2	Q9P278	1114 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CA3	P07451	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SHH	Q15465	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SNF8	Q96H20	258 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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