RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 LMO2P25791 158 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PPM1JQ5JR12 505 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PID1Q7Z2X4 250 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ABLIM1O14639 778 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TM9SF1O15321 606 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 WFS1O76024 890 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PGM3O95394 542 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ARL4AP40617 200 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 H3BRB1 525 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 BTKQ06187 659 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC185Q8N715 623 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SNX25Q9H3E2 840 aa20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ERVK-10P10266 1014 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MGAT1P26572 445 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ADORA2AP29274 412 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF358Q9NW07 568 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CDK16Q00536 496 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 STX3Q13277 289 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 BOLA3Q53S33 107 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PQLC3Q8N755 202 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TTC16Q8NEE8 873 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 NDNQ99608 321 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TNFAIP2Q03169 654 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 IL31Q6EBC2 164 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TNS4Q8IZW8 715 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 AZIN2Q96A70 460 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 OPTNQ96CV9 577 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PHF12Q96QT6 1004 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 NDC80O14777 642 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CIB2O75838 187 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PDE5AO76074 875 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 OR6B1O95007 311 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 APOEP02649 317 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA31D3P0C874 917 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TPH1P17752 444 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TYK2P29597 1187 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 LPCAT4Q643R3 524 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 USP33Q8TEY7 942 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 USP29Q9HBJ7 922 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 KRT82Q9NSB4 513 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 NEMP1O14524 444 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 C22orf31O95567 290 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SERPINB6P35237 376 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SULT1E1P49888 294 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CCNG1P51959 295 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 FZD9O00144 591 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 LYNP07948 512 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 RARBP10826 455 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP8P85298 464 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC6A3Q01959 620 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ATG16L1Q676U5 607 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 RASSF3Q86WH2 238 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms